铜仁学院设有35个本科专业，现有省级特色专业2个、省级综合改革试点专业3个、省级实验教学示范中心1个、卓越人才培养改革试点专业1个；省级重点学科1个、重点支持学科2个、省高校重点特色实验室2个、省级工程（技术）中心2个、省高校工程中心1个、省高校产学研基地3个；贵州省2011协同创新项目（培育）1个、贵州省人文社科基地1个、贵州省民族传统体育训练基地1个。近年来，教师教改科研立项数981项，出版教材和著作54部，获省级教学、科研成果奖10项，市厅级以上教学、科研成果奖26项。特别是2012年，入围贵州省高校“125”重大科技专项4项，排名贵州省高校第五，贵州省新建本科高校第一；2013年，获国家人文社科项目3项、教育部人文社会科学研究项目1项、国家自然科学基金项目4项、省级教改重大招标课题4项，省级教学成果奖7项，排名贵州省新建本科高校第一。学校荣获贵州省高校2012年目标绩效考核二等奖（列贵州省高校第四名、贵州省新建本科高校第一名）。

参与中心建设的铜仁学院经济与管理科学系现有农村区域发展、旅游管理、地理科学、金融工程、城乡规划五个专业，拥有省部级以上科研项目24项，地厅级项目9项，出版学术专著2部，主编教材2部，发表学术论文近130余篇；有省级精品课程1门、校级重点学科2个。作为贵州武陵山片区内的本科院校，铜仁学院积极参与武陵山片区扶贫与发展问题研究，其中，教育部人文社科重点研究基地华中师范大学中国农村研究院武陵山区研究基地于2011年6月落户铜仁学院，极大地提升了铜仁学院参与武陵山片区扶贫与发展研究的实力。此外，铜仁学院也与吉首大学、重庆师范大学、中南民族大学建立了良好的合作研究联系。